RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 ERCC6Q03468 1493 aa11.44□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 TRIM27P14373 513 aa11.44□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 CPLX3Q8WVH0 158 aa11.44□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 STAC3Q96MF2 364 aa11.44□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 DNAI1Q9UI46 699 aa11.44□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 BIN1O00499 593 aa11.44□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 STX1AQ16623 288 aa11.44□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 USP48Q86UV5 1035 aa11.44□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 SNX21Q969T3 373 aa11.44□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 RBSNQ9H1K0 784 aa11.44□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa11.44□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 CTAGE5O15320 804 aa11.43□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 SIL1Q9H173 461 aa11.43□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 PTGS1P23219 599 aa11.43□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP11.43□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 SART3Q15020 963 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 TMX3Q96JJ7 454 aa11.43□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 CNPY2Q9Y2B0 182 aa11.43□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 SRGAP3O43295 1099 aa11.43□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 GJB2P29033 226 aa11.43□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 TMPOP42166 694 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 EIF5P55010 431 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 STIM1Q13586 685 aa11.43□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 MTMR7Q9Y216 660 aa11.43□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 FYB1O15117 783 aa11.42□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 AACSQ86V21 672 aa11.42□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 SMC5Q8IY18 1101 aa11.42□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 ZNF428Q96B54 188 aa11.42□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 TANGO6Q9C0B7 1094 aa11.42□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa11.42□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 ANO6Q4KMQ2 910 aa11.42□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 MYRIPQ8NFW9 859 aa11.42□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 FAM200AQ8TCP9 573 aa11.42□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 KLHL10Q6JEL2 608 aa11.42□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 FSIP1Q8NA03 581 aa11.42□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 TERF1P54274 439 aa11.41□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 CCDC150Q8NCX0 1101 aa11.41□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 GUCY1B3Q02153 619 aa11.41□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 AMOTL1Q8IY63 956 aa11.41□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa11.41□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 KRT32Q14532 448 aa11.41□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 TSC1Q92574 1164 aa11.41□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP11.41□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 ANKRD62A6NC57 917 aa11.41□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 RAB11FIP3O75154 756 aa11.41□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 KRBA2Q6ZNG9 492 aa11.41□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 CCDC113Q9H0I3 377 aa11.41□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 MAP3K1Q13233 1512 aa11.41□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 ATP2C2O75185 946 aa11.4□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 TAF4BQ92750 862 aa11.4□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 TDO2P48775 406 aa11.4□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 TRIM22Q8IYM9 498 aa11.4□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 VPS18Q9P253 973 aa11.4□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa11.4□□□□□ -0.59
HERC3-202ENST00000402738 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.59
HERC3-202ENST00000402738 ERICH3Q5RHP9 1530 aa11.39□□□□□ -0.59
HERC3-202ENST00000402738 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
HERC3-202ENST00000402738 DNA2P51530 1060 aa11.39□□□□□ -0.59
HERC3-202ENST00000402738 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa11.39□□□□□ -0.59
HERC3-202ENST00000402738 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
HERC3-202ENST00000402738 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
HERC3-202ENST00000402738 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa11.39□□□□□ -0.59
HERC3-202ENST00000402738 PDS5BQ9NTI5 1447 aa11.39□□□□□ -0.59
HERC3-202ENST00000402738 GPRASP1Q5JY77 1395 aa11.39□□□□□ -0.59
HERC3-202ENST00000402738 ISM2Q6H9L7 571 aa11.39□□□□□ -0.59
HERC3-202ENST00000402738 NAIPQ13075 1403 aa11.39□□□□□ -0.59
HERC3-202ENST00000402738 A0A1B0GUL7 405 aa11.38□□□□□ -0.59
HERC3-202ENST00000402738 PHACTR2O75167 634 aa11.38□□□□□ -0.59
HERC3-202ENST00000402738 CAVIN2O95810 425 aa11.38□□□□□ -0.59
HERC3-202ENST00000402738 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
HERC3-202ENST00000402738 SPA17Q15506 151 aa11.38□□□□□ -0.59
HERC3-202ENST00000402738 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
HERC3-202ENST00000402738 CEP57Q86XR8 500 aa11.38□□□□□ -0.59
HERC3-202ENST00000402738 VPS37DQ86XT2 251 aa11.38□□□□□ -0.59
HERC3-202ENST00000402738 DNAJC25Q9H1X3 360 aa11.38□□□□□ -0.59
HERC3-202ENST00000402738 TTC22Q5TAA0 569 aa11.38□□□□□ -0.59
HERC3-202ENST00000402738 CCDC91Q7Z6B0 441 aa11.38□□□□□ -0.59
HERC3-202ENST00000402738 LUZP1Q86V48 1076 aa11.38□□□□□ -0.59
HERC3-202ENST00000402738 JPH4Q96JJ6 628 aa11.38□□□□□ -0.59
HERC3-202ENST00000402738 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
HERC3-202ENST00000402738 NUCB1Q02818 461 aa11.38□□□□□ -0.59
HERC3-202ENST00000402738 IFFO1Q0D2I5 559 aa11.38□□□□□ -0.59
HERC3-202ENST00000402738 SLC26A8Q96RN1 970 aa11.38□□□□□ -0.59
HERC3-202ENST00000402738 CCDC175P0C221 793 aa11.37□□□□□ -0.59
HERC3-202ENST00000402738 ALDH1L2Q3SY69 923 aa11.37□□□□□ -0.59
HERC3-202ENST00000402738 SULT6B1Q6IMI4 303 aa11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.7 ms