RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384712.1

RNU6-417P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 417, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-417P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-417P-201ENST00000384712 CYLDQ9NQC7 956 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-417P-201ENST00000384712 WASLO00401 505 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-417P-201ENST00000384712 PAX4O43316 350 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-417P-201ENST00000384712 CLN3Q13286 438 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-417P-201ENST00000384712 TAS1R3Q7RTX0 852 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-417P-201ENST00000384712 SEPT12Q8IYM1 358 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-417P-201ENST00000384712 PLVAPQ9BX97 442 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-417P-201ENST00000384712 LIMD1Q9UGP4 676 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-417P-201ENST00000384712 MEN1O00255 615 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-417P-201ENST00000384712 FGFR3P22607 806 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-417P-201ENST00000384712 CTBSQ01459 385 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-417P-201ENST00000384712 FZD5Q13467 585 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-417P-201ENST00000384712 PPP2R2DQ66LE6 453 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-417P-201ENST00000384712 TSC1Q92574 1164 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-417P-201ENST00000384712 NEURL1BA8MQ27 555 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-417P-201ENST00000384712 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
RNU6-417P-201ENST00000384712 KLF15Q9UIH9 416 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-417P-201ENST00000384712 A0A1B0GTH6 734 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-417P-201ENST00000384712 BNIP3LO60238 219 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-417P-201ENST00000384712 RAB15P59190 212 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-417P-201ENST00000384712 PTK2Q05397 1052 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-417P-201ENST00000384712 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
RNU6-417P-201ENST00000384712 SLC27A3Q5K4L6 730 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-417P-201ENST00000384712 FCHSD1Q86WN1 690 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-417P-201ENST00000384712 ABHD17AQ96GS6 310 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-417P-201ENST00000384712 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-417P-201ENST00000384712 ERVK-9P63128 1117 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-417P-201ENST00000384712 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-417P-201ENST00000384712 MDFIQ99750 246 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-417P-201ENST00000384712 GPAMQ9HCL2 828 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-417P-201ENST00000384712 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
RNU6-417P-201ENST00000384712 HCN2Q9UL51 889 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-417P-201ENST00000384712 ADH6P28332 368 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-417P-201ENST00000384712 MYSM1Q5VVJ2 828 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-417P-201ENST00000384712 TRIM52Q96A61 297 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-417P-201ENST00000384712 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-417P-201ENST00000384712 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-417P-201ENST00000384712 ELNP15502 786 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-417P-201ENST00000384712 LAMC2Q13753 1193 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-417P-201ENST00000384712 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-417P-201ENST00000384712 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-417P-201ENST00000384712 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-417P-201ENST00000384712 NLRP3Q96P20 1036 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-417P-201ENST00000384712 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-417P-201ENST00000384712 FAM182BQ5T319 152 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-417P-201ENST00000384712 CRISPLD1Q9H336 500 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-417P-201ENST00000384712 HRH3Q9Y5N1 445 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-417P-201ENST00000384712 SPDYE3A6NKU9 549 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-417P-201ENST00000384712 TRAK2O60296 914 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-417P-201ENST00000384712 APBA3O96018 575 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-417P-201ENST00000384712 CTDSPL2Q05D32 466 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-417P-201ENST00000384712 PRRT3Q5FWE3 981 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-417P-201ENST00000384712 PARP9Q8IXQ6 854 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-417P-201ENST00000384712 LRRN4Q8WUT4 740 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-417P-201ENST00000384712 RUBCNLQ9H714 662 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-417P-201ENST00000384712 RNF112Q9ULX5 631 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-417P-201ENST00000384712 ADGRE1Q14246 886 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-417P-201ENST00000384712 LCE4AQ5TA78 99 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-417P-201ENST00000384712 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-417P-201ENST00000384712 NACC1Q96RE7 527 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-417P-201ENST00000384712 PRDM6Q9NQX0 595 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-417P-201ENST00000384712 MSX1P28360 303 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-417P-201ENST00000384712 MBTPS1Q14703 1052 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-417P-201ENST00000384712 NR6A1Q15406 480 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-417P-201ENST00000384712 EFHC2Q5JST6 749 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-417P-201ENST00000384712 CYP2U1Q7Z449 544 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-417P-201ENST00000384712 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-417P-201ENST00000384712 CCDC125Q86Z20 511 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-417P-201ENST00000384712 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-417P-201ENST00000384712 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-417P-201ENST00000384712 PGBD3Q8N328 593 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-417P-201ENST00000384712 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-417P-201ENST00000384712 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-417P-201ENST00000384712 JAG1P78504 1218 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-417P-201ENST00000384712 C4orf17Q53FE4 359 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-417P-201ENST00000384712 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-417P-201ENST00000384712 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-417P-201ENST00000384712 OSBPL3Q9H4L5 887 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-417P-201ENST00000384712 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-417P-201ENST00000384712 FAM229AH3BQW9 127 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-417P-201ENST00000384712 IL2RAP01589 272 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-417P-201ENST00000384712 PHKA2P46019 1235 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-417P-201ENST00000384712 SCTRP47872 440 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-417P-201ENST00000384712 FIGNL1Q6PIW4 674 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-417P-201ENST00000384712 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-417P-201ENST00000384712 CENPCQ03188 943 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-417P-201ENST00000384712 BARGINQ6ZT62 677 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-417P-201ENST00000384712 TXNRD3Q86VQ6 643 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-417P-201ENST00000384712 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-417P-201ENST00000384712 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
RNU6-417P-201ENST00000384712 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
RNU6-417P-201ENST00000384712 NID1P14543 1247 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-417P-201ENST00000384712 SELPP16109 830 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-417P-201ENST00000384712 TNP2Q05952 138 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-417P-201ENST00000384712 GRIK4Q16099 956 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-417P-201ENST00000384712 ELOA3BQ3SY89 546 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-417P-201ENST00000384712 NLRP8Q86W28 1048 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-417P-201ENST00000384712 ELOA3Q8NG57 546 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-417P-201ENST00000384712 C9orf172C9J069 976 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-417P-201ENST00000384712 MAPTP10636 758 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 205.8 ms