RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 SCAPERQ9BY12 1400 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 ANKRD33BA6NCL7 494 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 CENPOQ9BU64 300 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 PTPRTO14522 1441 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 IFT88Q13099 833 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC70Q6NSX1 233 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 KCNV1Q6PIU1 500 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 PANK3Q9H999 370 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 BRMS1Q9HCU9 246 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 YEATS2Q9ULM3 1422 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 PSMD2Q13200 908 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 E2F4Q16254 413 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 BACH2Q9BYV9 841 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 VWDEQ8N2E2 1590 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 MROH1Q8NDA8 1641 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC7A5Q01650 507 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 KLF15Q9UIH9 416 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 ZBED9Q6R2W3 1325 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 APLP1P51693 650 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 MNS1Q8NEH6 495 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 CEP126Q9P2H0 1117 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 SYCP2Q9BX26 1530 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM177BA6PVY3 158 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 ERCC3P19447 782 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 SAPCD2Q86UD0 394 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 MIA2Q96PC5 1412 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 NLRP1Q9C000 1473 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 FCHSD2O94868 740 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 AMOTQ4VCS5 1084 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 PARNO95453 639 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM200BP0CF97 657 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP8.23□□□□□ -1.091e-6■■■■□ 24.6
RABGEF1-202ENST00000380828 MYOM3Q5VTT5 1437 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 TGFB3P10600 412 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 LIG1P18858 919 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 NEK9Q8TD19 979 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 LMTK2Q8IWU2 1503 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 EXOC5O00471 708 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 TATDN2Q93075 761 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 KIF3CO14782 793 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 KINO60870 393 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 NCOA2Q15596 1464 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 GSCP56915 257 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 RETREG2Q8NC44 543 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 MYBL2P10244 700 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 CALRP27797 417 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 AKNAD1Q5T1N1 836 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 HSCBQ8IWL3 235 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 SPOCK3Q9BQ16 436 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 FLT3P36888 993 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGEF1-202ENST00000380828 RASA3Q14644 834 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGEF1-202ENST00000380828 INF2Q27J81 1249 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGEF1-202ENST00000380828 OGFOD1Q8N543 542 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGEF1-202ENST00000380828 RSPH1Q8WYR4 309 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGEF1-202ENST00000380828 RASSF4Q9H2L5 321 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGEF1-202ENST00000380828 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
RABGEF1-202ENST00000380828 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
RABGEF1-202ENST00000380828 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGEF1-202ENST00000380828 TRIM66O15016 1216 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGEF1-202ENST00000380828 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
RABGEF1-202ENST00000380828 NFXL1Q6ZNB6 911 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGEF1-202ENST00000380828 FBXW7Q969H0 707 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGEF1-202ENST00000380828 IGSF5Q9NSI5 407 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGEF1-202ENST00000380828 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
RABGEF1-202ENST00000380828 JRKLQ9Y4A0 524 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGEF1-202ENST00000380828 LTBP4Q8N2S1 1624 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-202ENST00000380828 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-202ENST00000380828 LZTS2Q9BRK4 669 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-202ENST00000380828 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-202ENST00000380828 CFAP69A5D8W1 941 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-202ENST00000380828 TBC1D25Q3MII6 688 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-202ENST00000380828 C11orf96Q7Z7L8 435 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-202ENST00000380828 ZSCAN30Q86W11 494 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-202ENST00000380828 MKS1Q9NXB0 559 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-202ENST00000380828 PTPN23Q9H3S7 1636 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-202ENST00000380828 IL16Q14005 1332 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-202ENST00000380828 MYSM1Q5VVJ2 828 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-202ENST00000380828 CTR9Q6PD62 1173 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM165Q9HC07 324 aa8.2□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms