RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356455.8

UBE2C-204, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2C, Length 850 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2C-204ENST00000356455 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa25.62■■□□□ 1.69
UBE2C-204ENST00000356455 NMRK2Q9NPI5 230 aa25.62■■□□□ 1.69
UBE2C-204ENST00000356455 NLGN1Q8N2Q7 840 aa25.61■■□□□ 1.69
UBE2C-204ENST00000356455 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
UBE2C-204ENST00000356455 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
UBE2C-204ENST00000356455 FCHSD2O94868 740 aa25.6■■□□□ 1.69
UBE2C-204ENST00000356455 IFNL2Q8IZJ0 200 aa25.6■■□□□ 1.69
UBE2C-204ENST00000356455 ATG3Q9NT62 314 aa25.6■■□□□ 1.69
UBE2C-204ENST00000356455 CCDC87Q9NVE4 849 aa25.6■■□□□ 1.69
UBE2C-204ENST00000356455 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
UBE2C-204ENST00000356455 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP25.59■■□□□ 1.69
UBE2C-204ENST00000356455 NCAPD2Q15021 1401 aa25.58■■□□□ 1.69
UBE2C-204ENST00000356455 PHKG2P15735 406 aa25.58■■□□□ 1.69
UBE2C-204ENST00000356455 DPEP1P16444 411 aa25.58■■□□□ 1.69
UBE2C-204ENST00000356455 CDCA8Q53HL2 280 aa25.58■■□□□ 1.69
UBE2C-204ENST00000356455 EYA1Q99502 592 aa25.58■■□□□ 1.69
UBE2C-204ENST00000356455 KIF13BQ9NQT8 1826 aa25.58■■□□□ 1.68
UBE2C-204ENST00000356455 C10orf71Q711Q0 1435 aa25.57■■□□□ 1.68
UBE2C-204ENST00000356455 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
UBE2C-204ENST00000356455 PARP3Q9Y6F1 533 aa25.56■■□□□ 1.68
UBE2C-204ENST00000356455 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa25.56■■□□□ 1.68
UBE2C-204ENST00000356455 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
UBE2C-204ENST00000356455 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.55■■□□□ 1.68
UBE2C-204ENST00000356455 RFC4P35249 363 aa25.54■■□□□ 1.68
UBE2C-204ENST00000356455 C9orf131Q5VYM1 1079 aa25.54■■□□□ 1.68
UBE2C-204ENST00000356455 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
UBE2C-204ENST00000356455 CARD14Q9BXL6 1004 aa25.54■■□□□ 1.68
UBE2C-204ENST00000356455 ADRA2BP18089 450 aa25.52■■□□□ 1.68
UBE2C-204ENST00000356455 WDR90Q96KV7 1748 aa25.51■■□□□ 1.68
UBE2C-204ENST00000356455 GYS1P13807 737 aa25.51■■□□□ 1.67
UBE2C-204ENST00000356455 HTRA3P83110 453 aa25.51■■□□□ 1.67
UBE2C-204ENST00000356455 KDRP35968 1356 aa25.51■■□□□ 1.67
UBE2C-204ENST00000356455 C4AP0C0L4 1744 aa25.51■■□□□ 1.67
UBE2C-204ENST00000356455 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
UBE2C-204ENST00000356455 KLRG1Q96E93 195 aa25.5■■□□□ 1.67
UBE2C-204ENST00000356455 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.5■■□□□ 1.67
UBE2C-204ENST00000356455 SLC4A9Q96Q91 983 aa25.49■■□□□ 1.67
UBE2C-204ENST00000356455 PIM2Q9P1W9 311 aa25.49■■□□□ 1.67
UBE2C-204ENST00000356455 KDM2BQ8NHM5 1336 aa25.48■■□□□ 1.67
UBE2C-204ENST00000356455 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa25.48■■□□□ 1.67
UBE2C-204ENST00000356455 RPS6KA4O75676 772 aa25.48■■□□□ 1.67
UBE2C-204ENST00000356455 FSTL1Q12841 308 aa25.48■■□□□ 1.67
UBE2C-204ENST00000356455 ERVV-2B6SEH9 535 aa25.47■■□□□ 1.67
UBE2C-204ENST00000356455 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa25.46■■□□□ 1.67
UBE2C-204ENST00000356455 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
UBE2C-204ENST00000356455 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
UBE2C-204ENST00000356455 RNF181Q9P0P0 153 aa25.46■■□□□ 1.67
UBE2C-204ENST00000356455 CAPN15O75808 1086 aa25.45■■□□□ 1.66
UBE2C-204ENST00000356455 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
UBE2C-204ENST00000356455 KCNA3P22001 575 aa25.45■■□□□ 1.66
UBE2C-204ENST00000356455 POLKQ9UBT6 870 aa25.45■■□□□ 1.66
UBE2C-204ENST00000356455 KCPQ6ZWJ8 1503 aa25.45■■□□□ 1.66
UBE2C-204ENST00000356455 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
UBE2C-204ENST00000356455 DCAF5Q96JK2 942 aa25.44■■□□□ 1.66
UBE2C-204ENST00000356455 RRAGCQ9HB90 399 aa25.44■■□□□ 1.66
UBE2C-204ENST00000356455 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
UBE2C-204ENST00000356455 CABP4P57796 275 aa25.43■■□□□ 1.66
UBE2C-204ENST00000356455 JMYQ8N9B5 988 aa25.43■■□□□ 1.66
UBE2C-204ENST00000356455 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
UBE2C-204ENST00000356455 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
UBE2C-204ENST00000356455 ZNF831Q5JPB2 1677 aa25.42■■□□□ 1.66
UBE2C-204ENST00000356455 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa25.42■■□□□ 1.66
UBE2C-204ENST00000356455 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
UBE2C-204ENST00000356455 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
UBE2C-204ENST00000356455 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
UBE2C-204ENST00000356455 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
UBE2C-204ENST00000356455 TNS4Q8IZW8 715 aa25.39■■□□□ 1.66
UBE2C-204ENST00000356455 CHRNA5P30532 468 aa25.38■■□□□ 1.65
UBE2C-204ENST00000356455 FKBP8Q14318 412 aa25.38■■□□□ 1.65
UBE2C-204ENST00000356455 CRKLP46109 303 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
UBE2C-204ENST00000356455 DDR1Q08345 913 aa25.37■■□□□ 1.65
UBE2C-204ENST00000356455 SMC1BQ8NDV3 1235 aa25.37■■□□□ 1.65
UBE2C-204ENST00000356455 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
UBE2C-204ENST00000356455 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
UBE2C-204ENST00000356455 MTHFSP49914 203 aa25.35■■□□□ 1.65
UBE2C-204ENST00000356455 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
UBE2C-204ENST00000356455 AMOTQ4VCS5 1084 aa25.34■■□□□ 1.65
UBE2C-204ENST00000356455 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.34■■□□□ 1.65
UBE2C-204ENST00000356455 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
UBE2C-204ENST00000356455 C1orf141Q5JVX7 400 aa25.33■■□□□ 1.65
UBE2C-204ENST00000356455 RASSF7Q02833 373 aa25.31■■□□□ 1.64
UBE2C-204ENST00000356455 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa25.31■■□□□ 1.64
UBE2C-204ENST00000356455 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
UBE2C-204ENST00000356455 ZPR1O75312 459 aa25.3■■□□□ 1.64
UBE2C-204ENST00000356455 PRELPP51888 382 aa25.29■■□□□ 1.64
UBE2C-204ENST00000356455 SBF1O95248 1867 aa25.28■■□□□ 1.64
UBE2C-204ENST00000356455 TM4SF1P30408 202 aa25.27■■□□□ 1.64
UBE2C-204ENST00000356455 USPL1Q5W0Q7 1092 aa25.27■■□□□ 1.64
UBE2C-204ENST00000356455 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
UBE2C-204ENST00000356455 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
UBE2C-204ENST00000356455 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
UBE2C-204ENST00000356455 LMNB1P20700 586 aa25.25■■□□□ 1.63
UBE2C-204ENST00000356455 AEBP1Q8IUX7 1158 aa25.25■■□□□ 1.63
UBE2C-204ENST00000356455 TJP1Q07157 1748 aa25.24■■□□□ 1.63
UBE2C-204ENST00000356455 GLTPD2A6NH11 291 aa25.24■■□□□ 1.63
UBE2C-204ENST00000356455 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
UBE2C-204ENST00000356455 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
UBE2C-204ENST00000356455 DNAJC10Q8IXB1 793 aa25.23■■□□□ 1.63
UBE2C-204ENST00000356455 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
UBE2C-204ENST00000356455 NFIXQ14938 502 aa25.2■■□□□ 1.62
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