RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327307.11

RRN3-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3, Length 2,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-202ENST00000327307 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
RRN3-202ENST00000327307 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa8.47□□□□□ -1.05
RRN3-202ENST00000327307 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
RRN3-202ENST00000327307 ARMC5Q96C12 935 aa8.47□□□□□ -1.05
RRN3-202ENST00000327307 PDCL3Q9H2J4 239 aa8.47□□□□□ -1.05
RRN3-202ENST00000327307 NPHP1O15259 732 aa8.46□□□□□ -1.05
RRN3-202ENST00000327307 DNAJC6O75061 913 aa8.46□□□□□ -1.05
RRN3-202ENST00000327307 FAM160A1Q05DH4 1040 aa8.46□□□□□ -1.05
RRN3-202ENST00000327307 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
RRN3-202ENST00000327307 MSL1Q68DK7 614 aa8.46□□□□□ -1.05
RRN3-202ENST00000327307 CLASP1Q7Z460 1538 aa8.46□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 GRIN2BQ13224 1484 aa8.46□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 ABL2P42684 1182 aa8.46□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 CLK1P49759 484 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 EIF5P55010 431 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 KIAA2012Q0VF49 1180 aa8.46□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa8.46□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 FBXO33Q7Z6M2 555 aa8.46□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa8.46□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 CCDC89Q8N998 374 aa8.46□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 C22orf23Q9BZE7 217 aa8.46□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 AS3MTQ9HBK9 375 aa8.46□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 PHF8Q9UPP1 1060 aa8.46□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 SYNJ1O43426 1573 aa8.45□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa8.45□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 GNALP38405 381 aa8.45□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 GSE1Q14687 1217 aa8.45□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 HSP90B2PQ58FF3 399 aa8.45□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 KANK3Q6NY19 840 aa8.45□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 CATIPQ7Z7H3 387 aa8.45□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 TTC30AQ86WT1 665 aa8.45□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 CHPFQ8IZ52 775 aa8.45□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 CUX1P39880 1505 aa8.45□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 IFT88Q13099 833 aa8.44□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 CCDC93Q567U6 631 aa8.44□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 SYCP2LQ5T4T6 812 aa8.44□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 FAM43AQ8N2R8 423 aa8.44□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 ACAD8Q9UKU7 415 aa8.44□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa8.44□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 SYNJ2O15056 1496 aa8.44□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 PLIN1O60240 522 aa8.44□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 NAT2P11245 290 aa8.44□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 WASHC5Q12768 1159 aa8.44□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 MAP2K5Q13163 448 aa8.44□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 COL19A1Q14993 1142 aa8.44□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 E2F5Q15329 346 aa8.44□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa8.44□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 SGIP1Q9BQI5 828 aa8.44□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 CHMP3Q9Y3E7 222 aa8.44□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 SOWAHDA6NJG2 315 aa8.43□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 RBP3P10745 1247 aa8.43□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 LMNB1P20700 586 aa8.43□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 RAPGEF1Q13905 1077 aa8.43□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 VPS72Q15906 364 aa8.43□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa8.43□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 LCA5Q86VQ0 697 aa8.43□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 KIAA1958Q8N8K9 716 aa8.43□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 GOLGA1Q92805 767 aa8.43□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa8.43□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 ASAP1Q9ULH1 1129 aa8.43□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 TRIM64CA6NLI5 447 aa8.42□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 FOSL1P15407 271 aa8.42□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 AMPD3Q01432 767 aa8.42□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 KLHL10Q6JEL2 608 aa8.42□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa8.42□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 NDUFAF2Q8N183 169 aa8.42□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 SLC43A3Q8NBI5 491 aa8.42□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 IER2Q9BTL4 223 aa8.42□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 OSBPL2Q9H1P3 480 aa8.42□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 FANCIQ9NVI1 1328 aa8.42□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.42□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 PPFIA3O75145 1194 aa8.42□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 DUSP27Q5VZP5 1158 aa8.42□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa8.42□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 SLF2Q8IX21 1173 aa8.42□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 SAMD3Q8N6K7 520 aa8.42□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 ERP27Q96DN0 273 aa8.42□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 APBA2Q99767 749 aa8.42□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 NLRP2Q9NX02 1062 aa8.42□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 TBX3O15119 743 aa8.41□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 PRR29P0C7W0 189 aa8.41□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 RBL2Q08999 1139 aa8.41□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 NYAP1Q6ZVC0 841 aa8.41□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.8 ms