RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316412.9

PRAMEF20-201, Transcript of PRAME family member 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PRAMEF20, Length 1,597 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20-201ENST00000316412 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 ITGB4P16144 1822 aa22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 DDB1Q16531 1140 aa22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF20-201ENST00000316412 TSPYL6Q8N831 410 aa22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF20-201ENST00000316412 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF20-201ENST00000316412 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF20-201ENST00000316412 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF20-201ENST00000316412 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF20-201ENST00000316412 BTBD11A6QL63 1104 aa22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF20-201ENST00000316412 VAMP4O75379 141 aa22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF20-201ENST00000316412 KRT24Q2M2I5 525 aa22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF20-201ENST00000316412 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF20-201ENST00000316412 RARSP54136 660 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF20-201ENST00000316412 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF20-201ENST00000316412 KCNQ3O43525 872 aa22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF20-201ENST00000316412 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF20-201ENST00000316412 CABP4P57796 275 aa22.39■■□□□ 1.18
PRAMEF20-201ENST00000316412 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
PRAMEF20-201ENST00000316412 PAPPAQ13219 1627 aa22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF20-201ENST00000316412 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF20-201ENST00000316412 BCAR3O75815 825 aa22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF20-201ENST00000316412 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF20-201ENST00000316412 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF20-201ENST00000316412 ZNF428Q96B54 188 aa22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF20-201ENST00000316412 RGS12O14924 1447 aa22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF20-201ENST00000316412 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF20-201ENST00000316412 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF20-201ENST00000316412 ZNF790Q6PG37 636 aa22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF20-201ENST00000316412 SLC39A6Q13433 755 aa22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF20-201ENST00000316412 SSH1Q8WYL5 1049 aa22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF20-201ENST00000316412 CACNA1FO60840 1977 aa22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF20-201ENST00000316412 BRWD3Q6RI45 1802 aa22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF20-201ENST00000316412 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF20-201ENST00000316412 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF20-201ENST00000316412 A0A0G2JS52 829 aa22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF20-201ENST00000316412 MYT1Q01538 1121 aa22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF20-201ENST00000316412 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF20-201ENST00000316412 BCL9O00512 1426 aa22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF20-201ENST00000316412 C5P01031 1676 aa22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF20-201ENST00000316412 SEPT12Q8IYM1 358 aa22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF20-201ENST00000316412 PIGBQ92521 554 aa22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF20-201ENST00000316412 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF20-201ENST00000316412 PLIN1O60240 522 aa22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF20-201ENST00000316412 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF20-201ENST00000316412 HOXB7P09629 217 aa22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF20-201ENST00000316412 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF20-201ENST00000316412 SBF2Q86WG5 1849 aa22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF20-201ENST00000316412 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF20-201ENST00000316412 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF20-201ENST00000316412 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF20-201ENST00000316412 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF20-201ENST00000316412 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF20-201ENST00000316412 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF20-201ENST00000316412 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF20-201ENST00000316412 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 NEFLP07196 543 aa22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 ATG3Q9NT62 314 aa22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 NHSQ6T4R5 1651 aa22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 FKBP8Q14318 412 aa22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 KIF16BQ96L93 1317 aa22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 KCNQ2O43526 872 aa22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 FAM182BQ5T319 152 aa22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 BTAF1O14981 1849 aa22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 NECTIN2Q92692 538 aa22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF20-201ENST00000316412 SLC4A2P04920 1241 aa22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF20-201ENST00000316412 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF20-201ENST00000316412 TNNQ9UQP3 1299 aa22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF20-201ENST00000316412 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF20-201ENST00000316412 PDE3AQ14432 1141 aa22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF20-201ENST00000316412 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF20-201ENST00000316412 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF20-201ENST00000316412 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF20-201ENST00000316412 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF20-201ENST00000316412 ARHGAP45Q92619 1136 aa22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF20-201ENST00000316412 STK31Q9BXU1 1019 aa22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF20-201ENST00000316412 USP16Q9Y5T5 823 aa22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF20-201ENST00000316412 TJP1Q07157 1748 aa22.17■■□□□ 1.14
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