RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267176.8

SBNO1-201, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SBNO1, Length 11,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-201ENST00000267176 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
SBNO1-201ENST00000267176 MIS18AQ9NYP9 233 aa7.41□□□□□ -1.22
SBNO1-201ENST00000267176 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP7.41□□□□□ -1.229e-8■■■■■ 30.5
SBNO1-201ENST00000267176 BMP2KLQ5H9B9 411 aa7.41□□□□□ -1.22
SBNO1-201ENST00000267176 LRSAM1Q6UWE0 723 aa7.41□□□□□ -1.22
SBNO1-201ENST00000267176 SHTN1A0MZ66 631 aa7.41□□□□□ -1.22
SBNO1-201ENST00000267176 CCDC148Q8NFR7 591 aa7.41□□□□□ -1.22
SBNO1-201ENST00000267176 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
SBNO1-201ENST00000267176 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
SBNO1-201ENST00000267176 ALDH1L2Q3SY69 923 aa7.41□□□□□ -1.22
SBNO1-201ENST00000267176 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
SBNO1-201ENST00000267176 TXLNBQ8N3L3 684 aa7.41□□□□□ -1.22
SBNO1-201ENST00000267176 GBP3Q9H0R5 595 aa7.41□□□□□ -1.22
SBNO1-201ENST00000267176 SYNJ2O15056 1496 aa7.41□□□□□ -1.22
SBNO1-201ENST00000267176 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP7.41□□□□□ -1.22
SBNO1-201ENST00000267176 KIF1BPQ96EK5 621 aa7.41□□□□□ -1.22
SBNO1-201ENST00000267176 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP7.4□□□□□ -1.22
SBNO1-201ENST00000267176 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
SBNO1-201ENST00000267176 TMX1Q9H3N1 280 aa7.4□□□□□ -1.22
SBNO1-201ENST00000267176 TOP1P11387 765 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
SBNO1-201ENST00000267176 EIF5P55010 431 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
SBNO1-201ENST00000267176 KLHL10Q6JEL2 608 aa7.4□□□□□ -1.22
SBNO1-201ENST00000267176 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
SBNO1-201ENST00000267176 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
SBNO1-201ENST00000267176 GUCY1B3Q02153 619 aa7.4□□□□□ -1.22
SBNO1-201ENST00000267176 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa7.4□□□□□ -1.22
SBNO1-201ENST00000267176 TXNDC2Q86VQ3 553 aa7.4□□□□□ -1.22
SBNO1-201ENST00000267176 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa7.4□□□□□ -1.22
SBNO1-201ENST00000267176 ANKRD62A6NC57 917 aa7.4□□□□□ -1.22
SBNO1-201ENST00000267176 BTBD11A6QL63 1104 aa7.4□□□□□ -1.22
SBNO1-201ENST00000267176 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
SBNO1-201ENST00000267176 UBE2HP62256 183 aa7.4□□□□□ -1.22
SBNO1-201ENST00000267176 CCDC57Q2TAC2 916 aa7.4□□□□□ -1.22
SBNO1-201ENST00000267176 KIF6Q6ZMV9 814 aa7.4□□□□□ -1.22
SBNO1-201ENST00000267176 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
SBNO1-201ENST00000267176 ZHX3Q9H4I2 956 aa7.4□□□□□ -1.22
SBNO1-201ENST00000267176 NFE2L2Q16236 605 aa7.4□□□□□ -1.22
SBNO1-201ENST00000267176 STX6O43752 255 aa7.4□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 MAP9Q49MG5 647 aa7.4□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 ZNF165P49910 485 aa7.4□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 NACAP1Q9BZK3 213 aa7.4□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 GIMAP7Q8NHV1 300 aa7.39□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.231e-6■■■■■ 81.8
SBNO1-201ENST00000267176 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa7.39□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa7.39□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 GJB2P29033 226 aa7.39□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 MCM10Q7L590 875 aa7.39□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 GIMAP6Q6P9H5 292 aa7.39□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 CEP135Q66GS9 1140 aa7.39□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 BOLA2Q9H3K6 86 aa7.39□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa7.39□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 C8orf34Q49A92 452 aa7.39□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 ISM2Q6H9L7 571 aa7.39□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 GPATCH11Q8N954 259 aa7.39□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 DYDC1Q8WWB3 177 aa7.39□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 F6X3S4 739 aa7.38□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 RAI14Q9P0K7 980 aa7.38□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 CTAGE5O15320 804 aa7.38□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 LMAN1P49257 510 aa7.38□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 GSDMDP57764 484 aa7.38□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa7.38□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 CTNNA3Q9UI47 895 aa7.38□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 MCM3P25205 808 aa7.38□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 ESCO1Q5FWF5 840 aa7.38□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 SPG7Q9UQ90 795 aa7.38□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 CNNM3Q8NE01 707 aa7.38□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 C8orf76Q96K31 380 aa7.38□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 TIGD1Q96MW7 591 aa7.38□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 MAP3K1Q13233 1512 aa7.38□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 GNAT3A8MTJ3 354 aa7.37□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 TMC6Q7Z403 805 aa7.37□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 NEMFO60524 1076 aa7.37□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 BIN1O00499 593 aa7.37□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 TDO2P48775 406 aa7.37□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 CEP131Q9UPN4 1083 aa7.37□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa7.37□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa7.37□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 CCDC113Q9H0I3 377 aa7.37□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
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