RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP18.7■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa18.7■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 V9GYY5 206 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 SKILP12757 684 aa18.7■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 GIMAP6Q6P9H5 292 aa18.7■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa18.7■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 TRIM22Q8IYM9 498 aa18.7■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa18.7■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 TANGO6Q9C0B7 1094 aa18.7■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP18.7■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 EZRP15311 586 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 SYCP1Q15431 976 aa18.69■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 SPA17Q15506 151 aa18.69■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa18.69■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 HSPA4P34932 840 aa18.68■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 SNX21Q969T3 373 aa18.68■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 STX6O43752 255 aa18.68■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa18.68■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 PAFAH1B1P43034 410 aa18.68■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 MCM6Q14566 821 aa18.68■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa18.68■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 TUBB4AP04350 444 aa18.67■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 IFFO1Q0D2I5 559 aa18.67■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 RAB3GAP1Q15042 981 aa18.67■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 CDKL5O76039 1030 aa18.67■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 FAM177BA6PVY3 158 aa18.67■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 DUSP27Q5VZP5 1158 aa18.67■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 FAM200AQ8TCP9 573 aa18.67■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 CCDC113Q9H0I3 377 aa18.67■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP18.66■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 DNAI1Q9UI46 699 aa18.66■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 MX1P20591 662 aa18.66■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 RAD21O60216 631 aa18.66■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 MYRIPQ8NFW9 859 aa18.66■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 GBP6Q6ZN66 633 aa18.65■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 NCOA2Q15596 1464 aa18.65■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 EBAG9O00559 213 aa18.65■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa18.65■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa18.64■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 KRBA2Q6ZNG9 492 aa18.64■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 CABP2Q9NPB3 220 aa18.64■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 ERBINQ96RT1 1412 aa18.64■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 HFM1A2PYH4 1435 aa18.64■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 LIG1P18858 919 aa18.64■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP18.64■□□□□ 0.574e-9■■□□□ 11.4
CTIF-201ENST00000256413 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa18.64■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 FYCO1Q9BQS8 1478 aa18.64■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 FSIP1Q8NA03 581 aa18.63■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP18.63■□□□□ 0.573e-7■■■■■ 250.1
CTIF-201ENST00000256413 SMC5Q8IY18 1101 aa18.63■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 NBPF11Q86T75 865 aa18.63■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 VPS37DQ86XT2 251 aa18.63■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 CPLX3Q8WVH0 158 aa18.62■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 VPS18Q9P253 973 aa18.62■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 CADPSQ9ULU8 1353 aa18.62■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 CEP57Q86XR8 500 aa18.62■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 SSH1Q8WYL5 1049 aa18.62■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 GJB2P29033 226 aa18.62■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 GTF3C6Q969F1 213 aa18.62■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 USO1O60763 962 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 SPECC1Q5M775 1068 aa18.61■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 HSF2BPO75031 334 aa18.61■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 YEATS4O95619 227 aa18.61■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa18.61■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 ANO6Q4KMQ2 910 aa18.61■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 KRT18P05783 430 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 MYZAPP0CAP1 466 aa18.61■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 USP48Q86UV5 1035 aa18.61■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa18.61■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 AACSQ86V21 672 aa18.61■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 OTUD6BQ8N6M0 293 aa18.61■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 KLHL10Q6JEL2 608 aa18.6■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 JPH4Q96JJ6 628 aa18.6■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 CTAGE15A4D2H0 777 aa18.6■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 CTAGE8P0CG41 777 aa18.6■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 MAATS1Q7Z4T9 603 aa18.6■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 CTAGE6Q86UF2 777 aa18.6■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 CTAGE4Q8IX94 777 aa18.6■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 ATP2C2O75185 946 aa18.6■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 GOLGA1Q92805 767 aa18.6■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 TMX3Q96JJ7 454 aa18.6■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 CCDC69A6NI79 296 aa18.6■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 GAS2L2Q8NHY3 880 aa18.6■□□□□ 0.57
CTIF-201ENST00000256413 ARAP1Q96P48 1450 aa18.6■□□□□ 0.57
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