RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249501.4

HOXD10-201, Transcript of homeobox D10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD10, Length 1,989 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10-201ENST00000249501 USP35Q9P2H5 1018 aa24.29■■□□□ 1.48
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HOXD10-201ENST00000249501 ADAMTS2O95450 1211 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD10-201ENST00000249501 SLC4A2P04920 1241 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD10-201ENST00000249501 IL2RBP14784 551 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD10-201ENST00000249501 NECTIN2Q92692 538 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD10-201ENST00000249501 SHANK3Q9BYB0 1731 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD10-201ENST00000249501 PLCH1Q4KWH8 1693 aa24.27■■□□□ 1.48
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HOXD10-201ENST00000249501 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
HOXD10-201ENST00000249501 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
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HOXD10-201ENST00000249501 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
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HOXD10-201ENST00000249501 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.22■■□□□ 1.47
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HOXD10-201ENST00000249501 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa24.21■■□□□ 1.47
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HOXD10-201ENST00000249501 PTPRCP08575 1304 aa24.21■■□□□ 1.47
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HOXD10-201ENST00000249501 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa24.17■■□□□ 1.46
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HOXD10-201ENST00000249501 ZNF790Q6PG37 636 aa24.17■■□□□ 1.46
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HOXD10-201ENST00000249501 C1orf115Q9H7X2 142 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD10-201ENST00000249501 SLC4A10Q6U841 1118 aa24.11■■□□□ 1.45
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HOXD10-201ENST00000249501 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
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HOXD10-201ENST00000249501 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
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HOXD10-201ENST00000249501 C8orf37Q96NL8 207 aa24.05■■□□□ 1.44
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HOXD10-201ENST00000249501 EXOC5O00471 708 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXD10-201ENST00000249501 FMNL2Q96PY5 1086 aa24.04■■□□□ 1.44
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HOXD10-201ENST00000249501 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa24.03■■□□□ 1.44
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HOXD10-201ENST00000249501 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
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HOXD10-201ENST00000249501 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
HOXD10-201ENST00000249501 USP16Q9Y5T5 823 aa24.02■■□□□ 1.44
HOXD10-201ENST00000249501 TNS2Q63HR2 1409 aa24.02■■□□□ 1.44
HOXD10-201ENST00000249501 NGLY1Q96IV0 654 aa24.02■■□□□ 1.43
HOXD10-201ENST00000249501 HSPA1LP34931 641 aa24.01■■□□□ 1.43
HOXD10-201ENST00000249501 PDIA6Q15084 440 aa24.01■■□□□ 1.43
HOXD10-201ENST00000249501 LAMB4A4D0S4 1761 aa24.01■■□□□ 1.43
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