RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243108.4

HOXC6-201, Transcript of homeobox C6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC6, Length 1,733 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6-201ENST00000243108 ZBED9Q6R2W3 1325 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXC6-201ENST00000243108 AMOTQ4VCS5 1084 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXC6-201ENST00000243108 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
HOXC6-201ENST00000243108 ATG3Q9NT62 314 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXC6-201ENST00000243108 DCAF5Q96JK2 942 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXC6-201ENST00000243108 UBR3Q6ZT12 1888 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXC6-201ENST00000243108 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
HOXC6-201ENST00000243108 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXC6-201ENST00000243108 SIK1P57059 783 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXC6-201ENST00000243108 SLC16A10Q8TF71 515 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXC6-201ENST00000243108 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
HOXC6-201ENST00000243108 HMOX1P09601 288 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXC6-201ENST00000243108 ERVV-2B6SEH9 535 aa23.08■■□□□ 1.28
HOXC6-201ENST00000243108 ITPK1Q13572 414 aa23.08■■□□□ 1.28
HOXC6-201ENST00000243108 SMIM5Q71RC9 77 aa23.08■■□□□ 1.28
HOXC6-201ENST00000243108 SCN11AQ9UI33 1791 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXC6-201ENST00000243108 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
HOXC6-201ENST00000243108 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
HOXC6-201ENST00000243108 LINC00116Q8NCU8 138 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXC6-201ENST00000243108 ARXQ96QS3 562 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXC6-201ENST00000243108 SYT17Q9BSW7 474 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXC6-201ENST00000243108 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
HOXC6-201ENST00000243108 SLC4A9Q96Q91 983 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXC6-201ENST00000243108 C1orf141Q5JVX7 400 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXC6-201ENST00000243108 MSH5O43196 834 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXC6-201ENST00000243108 ATP6V1AP38606 617 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF831Q5JPB2 1677 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXC6-201ENST00000243108 CABP4P57796 275 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXC6-201ENST00000243108 MSL1Q68DK7 614 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXC6-201ENST00000243108 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXC6-201ENST00000243108 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
HOXC6-201ENST00000243108 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
HOXC6-201ENST00000243108 AK7Q96M32 723 aa23■■□□□ 1.27
HOXC6-201ENST00000243108 LGR6Q9HBX8 967 aa23■■□□□ 1.27
HOXC6-201ENST00000243108 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXC6-201ENST00000243108 MAP3K5Q99683 1374 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXC6-201ENST00000243108 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXC6-201ENST00000243108 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
HOXC6-201ENST00000243108 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
HOXC6-201ENST00000243108 PHF14O94880 888 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXC6-201ENST00000243108 POLD1P28340 1107 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXC6-201ENST00000243108 PPP2R1AP30153 589 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXC6-201ENST00000243108 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
HOXC6-201ENST00000243108 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
HOXC6-201ENST00000243108 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXC6-201ENST00000243108 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
HOXC6-201ENST00000243108 TJP1Q07157 1748 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXC6-201ENST00000243108 GNPATO15228 680 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXC6-201ENST00000243108 MRC1P22897 1456 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXC6-201ENST00000243108 RNMTO43148 476 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
HOXC6-201ENST00000243108 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
HOXC6-201ENST00000243108 SSFA2P28290 1259 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXC6-201ENST00000243108 KLHL34Q8N239 644 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXC6-201ENST00000243108 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
HOXC6-201ENST00000243108 NLGN2Q8NFZ4 835 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXC6-201ENST00000243108 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXC6-201ENST00000243108 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
HOXC6-201ENST00000243108 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXC6-201ENST00000243108 SLC39A6Q13433 755 aa22.89■■□□□ 1.26
HOXC6-201ENST00000243108 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.89■■□□□ 1.26
HOXC6-201ENST00000243108 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXC6-201ENST00000243108 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXC6-201ENST00000243108 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
HOXC6-201ENST00000243108 CFAP53Q96M91 514 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXC6-201ENST00000243108 C4AP0C0L4 1744 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXC6-201ENST00000243108 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXC6-201ENST00000243108 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
HOXC6-201ENST00000243108 IL17REQ8NFR9 667 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXC6-201ENST00000243108 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXC6-201ENST00000243108 YY1P25490 414 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXC6-201ENST00000243108 PRKAR2BP31323 418 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXC6-201ENST00000243108 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
HOXC6-201ENST00000243108 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
HOXC6-201ENST00000243108 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
HOXC6-201ENST00000243108 RPS6KA4O75676 772 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXC6-201ENST00000243108 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXC6-201ENST00000243108 CHD4Q14839 1912 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXC6-201ENST00000243108 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXC6-201ENST00000243108 NEFLP07196 543 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXC6-201ENST00000243108 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
HOXC6-201ENST00000243108 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.83■■□□□ 1.25
HOXC6-201ENST00000243108 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXC6-201ENST00000243108 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXC6-201ENST00000243108 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
HOXC6-201ENST00000243108 NUDCQ9Y266 331 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXC6-201ENST00000243108 FKBP8Q14318 412 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXC6-201ENST00000243108 ADRA2BP18089 450 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXC6-201ENST00000243108 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXC6-201ENST00000243108 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXC6-201ENST00000243108 GPR162Q16538 588 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXC6-201ENST00000243108 GYS1P13807 737 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXC6-201ENST00000243108 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.79■■□□□ 1.24
HOXC6-201ENST00000243108 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXC6-201ENST00000243108 FCHSD2O94868 740 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXC6-201ENST00000243108 MMP10P09238 476 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXC6-201ENST00000243108 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
HOXC6-201ENST00000243108 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.77■■□□□ 1.24
HOXC6-201ENST00000243108 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
HOXC6-201ENST00000243108 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
HOXC6-201ENST00000243108 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.1 ms