RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ubap1lG3UW59 384 aa14.81□□□□□ -0.04
Herc3-201ENSMUST00000031823 Taf7Q9R1C0 341 aa14.81□□□□□ -0.04
Herc3-201ENSMUST00000031823 Siglec1Q62230 1695 aa14.81□□□□□ -0.04
Herc3-201ENSMUST00000031823 Triml2E9PW10 424 aa14.8□□□□□ -0.04
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ssfa2Q922B9 1252 aa14.8□□□□□ -0.04
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ankrd44B2RXR6 993 aa14.79□□□□□ -0.04
Herc3-201ENSMUST00000031823 AampJ3QN89 436 aa14.79□□□□□ -0.04
Herc3-201ENSMUST00000031823 MarsQ68FL6 902 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nup153E9Q3G8 1462 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ankrd23Q812A3 306 aa14.79□□□□□ -0.04
Herc3-201ENSMUST00000031823 PigbQ9JJQ0 542 aa14.79□□□□□ -0.04
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nolc1E9Q5C9 702 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
Herc3-201ENSMUST00000031823 Flad1Q8R123 492 aa14.79□□□□□ -0.04
Herc3-201ENSMUST00000031823 Robo1O89026 1612 aa14.79□□□□□ -0.04
Herc3-201ENSMUST00000031823 Col1a2Q01149 1372 aa14.79□□□□□ -0.04
Herc3-201ENSMUST00000031823 Exoc6bA6H5Z3 810 aa14.78□□□□□ -0.04
Herc3-201ENSMUST00000031823 InhbeO08717 350 aa14.78□□□□□ -0.04
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sema6bO54951 886 aa14.78□□□□□ -0.04
Herc3-201ENSMUST00000031823 Prkab2Q6PAM0 271 aa14.78□□□□□ -0.04
Herc3-201ENSMUST00000031823 MypopQ8R4U1 393 aa14.78□□□□□ -0.04
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cfdp1O88271 295 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cnksr1A2A9K7 700 aa14.77□□□□□ -0.04
Herc3-201ENSMUST00000031823 SympkQ80X82 1284 aa14.77□□□□□ -0.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mphosph10Q810V0 681 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sgsm1Q8BPQ7 1093 aa14.77□□□□□ -0.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Q8BT18 775 aa14.77□□□□□ -0.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc39a6Q8C145 765 aa14.77□□□□□ -0.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kcnh4A2A5F7 1018 aa14.76□□□□□ -0.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 HnrnpuQ8VEK3 800 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Echdc1Q9D9V3 322 aa14.75□□□□□ -0.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ahnak2E9PYB0 1738 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 EspnQ9ET47 871 aa14.75□□□□□ -0.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Map3k13Q1HKZ5 959 aa14.74□□□□□ -0.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Prkar2bP31324 416 aa14.73□□□□□ -0.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Iqsec3Q3TES0 1195 aa14.73□□□□□ -0.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 CoilQ5SU73 570 aa14.73□□□□□ -0.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Znf521Q6KAS7 1311 aa14.73□□□□□ -0.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ints5Q8CHT3 1018 aa14.73□□□□□ -0.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rlbp1Q9Z275 317 aa14.73□□□□□ -0.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Jmjd4Q8BFT6 427 aa14.73□□□□□ -0.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Arfgef2A2A5R2 1792 aa14.73□□□□□ -0.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Irf9Q61179 399 aa14.73□□□□□ -0.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Map3k2Q61083 619 aa14.72□□□□□ -0.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Disp3A3KFU9 1347 aa14.72□□□□□ -0.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmem119Q8R138 280 aa14.72□□□□□ -0.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sart3Q9JLI8 962 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hdac6Q9Z2V5 1149 aa14.72□□□□□ -0.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tns2Q8CGB6 1400 aa14.71□□□□□ -0.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 AceP09470 1312 aa14.71□□□□□ -0.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa14.71□□□□□ -0.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trpm3Q5F4S9 1721 aa14.71□□□□□ -0.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zap70P43404 618 aa14.71□□□□□ -0.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Clcn1Q64347 994 aa14.71□□□□□ -0.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cap2Q9CYT6 476 aa14.71□□□□□ -0.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Abca15E9PWH4 1668 aa14.71□□□□□ -0.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gnai2P08752 355 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 Smc5Q8CG46 1101 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
Herc3-201ENSMUST00000031823 4930567H17RikQ3V0K5 233 aa14.7□□□□□ -0.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Klc3Q91W40 508 aa14.7□□□□□ -0.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trim30dE9PWL0 497 aa14.7□□□□□ -0.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Bsdc1Q80Y55 427 aa14.7□□□□□ -0.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Msh6P54276 1358 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Atl3Q91YH5 541 aa14.68□□□□□ -0.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc4a10Q5DTL9 1118 aa14.68□□□□□ -0.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sugp2Q8CH09 1067 aa14.68□□□□□ -0.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dcaf5Q80T85 946 aa14.68□□□□□ -0.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Bicc1Q99MQ1 977 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ttll7A4Q9F0 912 aa14.67□□□□□ -0.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Aldh1l2Q8K009 923 aa14.67□□□□□ -0.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pdia6Q922R8 440 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp142G5E869 1843 aa14.67□□□□□ -0.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 AU019823E9PUQ3 292 aa14.67□□□□□ -0.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vps33bP59016 617 aa14.67□□□□□ -0.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 SkilQ60665 675 aa14.67□□□□□ -0.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ankle2Q6P1H6 964 aa14.67□□□□□ -0.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rtn4Q99P72 1162 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Bicdl1A0JNT9 577 aa14.67□□□□□ -0.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cyp2d11P24457 504 aa14.67□□□□□ -0.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nip7Q9CXK8 180 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pde4dQ01063 747 aa14.66□□□□□ -0.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cwc27Q3TKY6 469 aa14.66□□□□□ -0.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Eif4g2Q62448 906 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Srgap3Q812A2 1099 aa14.66□□□□□ -0.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Atg3Q9CPX6 314 aa14.65□□□□□ -0.06
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccdc146E9Q9F7 977 aa14.64□□□□□ -0.07
Herc3-201ENSMUST00000031823 Syde2E9PUP1 1314 aa14.64□□□□□ -0.07
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cntnap1O54991 1385 aa14.64□□□□□ -0.07
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hspa2P17156 633 aa14.64□□□□□ -0.07
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm12185Q5NCB2 835 aa14.64□□□□□ -0.07
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gnl3lQ6PGG6 577 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Herc3-201ENSMUST00000031823 Map7O88735 730 aa14.64□□□□□ -0.07
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tceal9Q9DD24 104 aa14.64□□□□□ -0.07
Herc3-201ENSMUST00000031823 Morc2aQ69ZX6 1030 aa14.63□□□□□ -0.07
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fam13aQ8BGI4 693 aa14.63□□□□□ -0.07
Herc3-201ENSMUST00000031823 Taok3Q8BYC6 898 aa14.63□□□□□ -0.07
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lmbr1lQ9D1E5 489 aa14.63□□□□□ -0.07
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccdc27Q3V036 639 aa14.63□□□□□ -0.07
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fkbp5Q64378 456 aa14.63□□□□□ -0.07
Herc3-201ENSMUST00000031823 Bend3Q6PAL0 825 aa14.63□□□□□ -0.07
Herc3-201ENSMUST00000031823 Miga2Q8BK03 593 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17.3 ms