Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAMTA1Q9Y6Y1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAMTA1Q9Y6Y1 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms