Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms