Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF3C3Q9Y5Q9 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
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