Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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CHTOPQ9Y3Y2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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CHTOPQ9Y3Y2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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CHTOPQ9Y3Y2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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CHTOPQ9Y3Y2 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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CHTOPQ9Y3Y2 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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