Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAK1Q9UPV9 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms