Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV7

PHF24, PHD finger protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF24Q9UPV7 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PHF24Q9UPV7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PHF24Q9UPV7 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PHF24Q9UPV7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PHF24Q9UPV7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PHF24Q9UPV7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PHF24Q9UPV7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PHF24Q9UPV7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PHF24Q9UPV7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PHF24Q9UPV7 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHF24Q9UPV7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms