Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms