Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNMA2Q9UL42 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNMA2Q9UL42 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNMA2Q9UL42 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNMA2Q9UL42 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNMA2Q9UL42 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA2Q9UL42 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA2Q9UL42 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA2Q9UL42 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA2Q9UL42 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA2Q9UL42 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA2Q9UL42 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA2Q9UL42 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA2Q9UL42 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA2Q9UL42 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA2Q9UL42 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA2Q9UL42 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA2Q9UL42 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA2Q9UL42 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA2Q9UL42 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA2Q9UL42 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA2Q9UL42 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA2Q9UL42 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA2Q9UL42 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA2Q9UL42 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA2Q9UL42 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA2Q9UL42 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA2Q9UL42 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA2Q9UL42 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA2Q9UL42 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA2Q9UL42 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA2Q9UL42 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA2Q9UL42 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA2Q9UL42 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA2Q9UL42 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA2Q9UL42 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA2Q9UL42 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA2Q9UL42 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA2Q9UL42 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA2Q9UL42 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA2Q9UL42 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA2Q9UL42 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA2Q9UL42 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA2Q9UL42 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA2Q9UL42 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA2Q9UL42 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA2Q9UL42 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA2Q9UL42 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms