Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
TNIKQ9UKE5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TNIKQ9UKE5 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms