Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBE1Q9UJT0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms