Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
IFT172Q9UG01 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms