Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TFIP11Q9UBB9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFIP11Q9UBB9 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms