Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNIP1Q9NZI2 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms