Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GDE1Q9NZC3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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