Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM4

TMEM106B, Transmembrane protein 106B, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106BQ9NUM4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM106BQ9NUM4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms