Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC39A9Q9NUM3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC39A9Q9NUM3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms