Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms