Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRN4Q9NRL3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
STRN4Q9NRL3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
STRN4Q9NRL3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRN4Q9NRL3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRN4Q9NRL3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
STRN4Q9NRL3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRN4Q9NRL3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRN4Q9NRL3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRN4Q9NRL3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRN4Q9NRL3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRN4Q9NRL3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRN4Q9NRL3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRN4Q9NRL3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRN4Q9NRL3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRN4Q9NRL3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRN4Q9NRL3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRN4Q9NRL3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRN4Q9NRL3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRN4Q9NRL3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRN4Q9NRL3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRN4Q9NRL3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRN4Q9NRL3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRN4Q9NRL3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRN4Q9NRL3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRN4Q9NRL3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRN4Q9NRL3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRN4Q9NRL3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRN4Q9NRL3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRN4Q9NRL3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRN4Q9NRL3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRN4Q9NRL3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
STRN4Q9NRL3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
STRN4Q9NRL3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRN4Q9NRL3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRN4Q9NRL3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRN4Q9NRL3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
STRN4Q9NRL3 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRN4Q9NRL3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRN4Q9NRL3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
STRN4Q9NRL3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRN4Q9NRL3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms