Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC31BQ9NQW1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms