Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CYLDQ9NQC7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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