Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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RAB9BQ9NP90 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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RAB9BQ9NP90 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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RAB9BQ9NP90 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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RAB9BQ9NP90 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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RAB9BQ9NP90 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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RAB9BQ9NP90 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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RAB9BQ9NP90 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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RAB9BQ9NP90 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB9BQ9NP90 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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