Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE7BQ9NP56 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE7BQ9NP56 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE7BQ9NP56 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE7BQ9NP56 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE7BQ9NP56 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE7BQ9NP56 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE7BQ9NP56 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE7BQ9NP56 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE7BQ9NP56 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE7BQ9NP56 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE7BQ9NP56 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE7BQ9NP56 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE7BQ9NP56 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE7BQ9NP56 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE7BQ9NP56 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE7BQ9NP56 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE7BQ9NP56 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE7BQ9NP56 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE7BQ9NP56 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE7BQ9NP56 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE7BQ9NP56 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE7BQ9NP56 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE7BQ9NP56 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE7BQ9NP56 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE7BQ9NP56 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE7BQ9NP56 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE7BQ9NP56 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDE7BQ9NP56 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE7BQ9NP56 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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