Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms