Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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