Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHMP4AQ9BY43 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4AQ9BY43 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms