Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCAPERQ9BY12 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms