Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms