Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD5Q99666 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms