Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms