Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.31
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