Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSNARE1Q96NA8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms