Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms