Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKNOX2Q96KN3 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKNOX2Q96KN3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms