Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED3Q96IU2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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