Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C18orf8Q96DM3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms