Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms