Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
HLA-CQ95604 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HLA-CQ95604 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HLA-CQ95604 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
HLA-CQ95604 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HLA-CQ95604 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HLA-CQ95604 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HLA-CQ95604 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HLA-CQ95604 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HLA-CQ95604 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HLA-CQ95604 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
HLA-CQ95604 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HLA-CQ95604 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HLA-CQ95604 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HLA-CQ95604 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HLA-CQ95604 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HLA-CQ95604 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HLA-CQ95604 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HLA-CQ95604 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HLA-CQ95604 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HLA-CQ95604 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HLA-CQ95604 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HLA-CQ95604 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HLA-CQ95604 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HLA-CQ95604 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HLA-CQ95604 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HLA-CQ95604 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HLA-CQ95604 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HLA-CQ95604 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
HLA-CQ95604 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
HLA-CQ95604 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
HLA-CQ95604 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HLA-CQ95604 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms