Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRUQ92729 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRUQ92729 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms