Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC12Q8WUD4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms